Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Brms1Q99N20 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms