Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms