Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PtprtQ99M80 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PtprtQ99M80 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PtprtQ99M80 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PtprtQ99M80 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms