Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nmd3Q99L48 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nmd3Q99L48 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms