Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
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TrabdQ99JY4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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TrabdQ99JY4 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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TrabdQ99JY4 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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TrabdQ99JY4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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TrabdQ99JY4 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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TrabdQ99JY4 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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TrabdQ99JY4 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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