Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lims1Q99JW4 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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