Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms