Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Hoxc12Q8K5B8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
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Hoxc12Q8K5B8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Hoxc12Q8K5B8 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
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Hoxc12Q8K5B8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Hoxc12Q8K5B8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Hoxc12Q8K5B8 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Hoxc12Q8K5B8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Hoxc12Q8K5B8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Hoxc12Q8K5B8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Hoxc12Q8K5B8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Hoxc12Q8K5B8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Hoxc12Q8K5B8 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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