Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms