Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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