Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms