Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg4aQ8C9S8 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Atg4aQ8C9S8 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms