Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc113Q8C5T8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms