Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms