Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 H2-M10.4-202ENSMUST00000169950 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm21287-201ENSMUST00000191377 696 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm43457-201ENSMUST00000200867 2409 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Ispd-203ENSMUST00000221177 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Ang4-201ENSMUST00000073860 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm10229-201ENSMUST00000089106 570 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Olfr140-201ENSMUST00000099757 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms