Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp40Q8BWR4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp40Q8BWR4 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp40Q8BWR4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp40Q8BWR4 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp40Q8BWR4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp40Q8BWR4 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp40Q8BWR4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Usp40Q8BWR4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp40Q8BWR4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp40Q8BWR4 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp40Q8BWR4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp40Q8BWR4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp40Q8BWR4 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp40Q8BWR4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp40Q8BWR4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp40Q8BWR4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp40Q8BWR4 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp40Q8BWR4 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp40Q8BWR4 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp40Q8BWR4 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp40Q8BWR4 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp40Q8BWR4 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp40Q8BWR4 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp40Q8BWR4 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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