Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ccdc30Q8BVF4 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ccdc30Q8BVF4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ccdc30Q8BVF4 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ccdc30Q8BVF4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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