Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q8BGC1 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q8BGC1 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms