Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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H2-M10.4Q85ZW8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
H2-M10.4Q85ZW8 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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