Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125 ms