Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pcsk9Q80W65 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Pcsk9Q80W65 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pcsk9Q80W65 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pcsk9Q80W65 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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