Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms