Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2bQ7TPM1 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms