Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Mvb12bQ6KAU4 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Mvb12bQ6KAU4 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Mvb12bQ6KAU4 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Mvb12bQ6KAU4 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mvb12bQ6KAU4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms