Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg9bQ6EBV9 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Atg9bQ6EBV9 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Atg9bQ6EBV9 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Atg9bQ6EBV9 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms