Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms