Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.83□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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