Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms