Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms