Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Cd47Q61735 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Cd47Q61735 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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