Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms