Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bhlha9Q5RJB0 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bhlha9Q5RJB0 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms