Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
BB287469Q3UT53 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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