Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms