Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmem253Q3UNB8 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms