Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hdgfl2Q3UMU9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hdgfl2Q3UMU9 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms