Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp19Q3UJD6 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp19Q3UJD6 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms