Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ssbp4Q3U4B1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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