Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CiartQ3TQ03 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms