Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Il20rb-201ENSMUST00000098458 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms