Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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