Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trim71Q1PSW8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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