Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Traf3ip1Q149C2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Traf3ip1Q149C2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Traf3ip1Q149C2 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Traf3ip1Q149C2 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Traf3ip1Q149C2 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Traf3ip1Q149C2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Traf3ip1Q149C2 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms