Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms