Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms