Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms