Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Nf1Q04690 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms