Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cxcr5Q04683 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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