Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ctnnb1Q02248 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctnnb1Q02248 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms