Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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